@misc{StadtmuellerWollnyTippkoetteretal.2012,
  author    = {Stadtm{\"u}ller, R. and Wollny, S. and Tippk{\"o}tter, Nils and Ulber, Roland},
  title     = {Amplifikation und Einsatz von ssDNA-Aptameren},
  series = {Chemie Ingenieur Technik},
  volume    = {84},
  journal   = {Chemie Ingenieur Technik},
  number    = {8},
  publisher = {Wiley-VCH},
  address   = {Weinheim},
  issn      = {0009-286X},
  doi       = {10.1002/cite.201250112},
  pages     = {1294},
  year      = {2012},
  abstract  = {Die wachsende Produktpalette von z. B. Pharmazeutika geht mit einer steigenden Nachfrage f{\"u}r hochsensitive/schonende Aufreinigungstechniken einher. Bisherige Verfahren f{\"u}hren oft zu geringer Reinheit und verminderter Bioaktivit{\"a}t, zeigen eine Limitation der Analytengr{\"o}ße oder bedingen dessen Modifikation. Durch die Kombination von mikroskaligen Magnetpartikeln und spezifisch wechselwirkenden Einzelstrang-DNA-Oligonukleotiden, den sog. ssDNA-Aptameren, sind eine h{\"o}here Selektivit{\"a}t/Reinheit und eine Automatisierung m{\"o}glich. In diesem Kontext werden zum einen ssDNA-Amplifikationstechniken und zum anderen der praktische Einsatz von Aptameren in einer Magnetseparation vorgestellt. Die ssDNA-Synthese basiert auf einem In-vivo-dsDNA-Produktionsschritt mittels eines rekombinanten Escherichia coli. Die als High-copy-Plasmid organisierte Sequenz wird in vitro durch Kombination verschiedener enzymatischer Reaktionen in die funktionelle ssDNA {\"u}berf{\"u}hrt. Diese Technik bedingt nur minimale Instrumentierung bzw. Prozessregelung. Die zweite Synthesetechnik wird in Form eines In-vitro-Amplifikationsverfahrens realisiert und beruht auf dem Prinzip einer PCR (Potenzial zu einer Automatisierung bzw. Miniaturisierung). Die gewonnenen Aptamere werden im Anschluss in einem auf Magnetpartikeln basierten Trennverfahren zur Isolationvon 6xHis-tag-Proteinen bez{\"u}glich ihrer Eigenschaften untersucht.},
  language  = {de}
}
@article{ScheerKapelyukhRodeetal.2012,
  author    = {Scheer, Nico and Kapelyukh, Yury and Rode, Anja and Buechel, Sandra and Wolf, C. Roland},
  title     = {Generation and characterization of novel cytochrome P450 Cyp2c gene cluster knockout and CYP2C9 humanized mouse lines},
  series = {Molecular Pharmacology},
  volume    = {82},
  journal   = {Molecular Pharmacology},
  number    = {6},
  publisher = {ASPET},
  address   = {Bethesda, Md.},
  issn      = {1521-0111},
  doi       = {10.1124/mol.112.080036},
  pages     = {1022 -- 1029},
  year      = {2012},
  abstract  = {Compared with rodents and many other animal species, the human cytochrome P450 (P450) Cyp2c gene cluster varies significantly in the multiplicity of functional genes and in the substrate specificity of its enzymes. As a consequence, the use of wild-type animal models to predict the role of human CYP2C enzymes in drug metabolism and drug-drug interactions is limited. Within the human CYP2C cluster CYP2C9 is of particular importance, because it is one of the most abundant P450 enzymes in human liver, and it is involved in the metabolism of a wide variety of important drugs and environmental chemicals. To investigate the in vivo functions of cytochrome P450 Cyp2c genes and to establish a model for studying the functions of CYP2C9 in vivo, we have generated a mouse model with a deletion of the murine Cyp2c gene cluster and a corresponding humanized model expressing CYP2C9 specifically in the liver. Despite the high number of functional genes in the mouse Cyp2c cluster and the reported roles of some of these proteins in different biological processes, mice deleted for Cyp2c genes were viable and fertile but showed certain phenotypic alterations in the liver. The expression of CYP2C9 in the liver also resulted in viable animals active in the metabolism and disposition of a number of CYP2C9 substrates. These mouse lines provide a powerful tool for studying the role of Cyp2c genes and of CYP2C9 in particular in drug disposition and as a factor in drug-drug interaction.},
  language  = {en}
}
@inproceedings{SiekerDuwePothetal.2012,
  author    = {Sieker, T. and Duwe, A. and Poth, S. and Tippk{\"o}tter, Nils and Ulber, Roland},
  title     = {Herstellung von Itacons{\"a}ure aus Buchenholzhydrolysaten},
  series = {Kurzfassungsband / GVC-DECHEMA Vortrags- und Diskussionstagung Biopharmazeutische Produktion : 14. - 16. Mai 2012. Konzerthaus Freibung},
  booktitle = {Kurzfassungsband / GVC-DECHEMA Vortrags- und Diskussionstagung Biopharmazeutische Produktion : 14. - 16. Mai 2012. Konzerthaus Freibung},
  publisher = {DECHEMA},
  address   = {Frankfurt, M.},
  pages     = {57},
  year      = {2012},
  language  = {de}
}
@misc{TippkoetterPasteurMeyeretal.2012,
  author    = {Tippk{\"o}tter, Nils and Pasteur, A. and Meyer, C. and Kampeis, P. and Diller, R. and Ulber, Roland},
  title     = {Aufreinigung von Cephalosporin C durch por{\"o}se, selektiv-beschichtete Magnetpartikel},
  series = {Chemie Ingenieur Technik},
  volume    = {84},
  journal   = {Chemie Ingenieur Technik},
  number    = {8},
  publisher = {Wiley-VCH},
  address   = {Weinheim},
  issn      = {0009-286X},
  doi       = {10.1002/cite.201250391},
  pages     = {1369 -- 1370},
  year      = {2012},
  abstract  = {Die selektive Isolierung von Cephalosporin C (CPC) aus komplexen Fermentationssuspensionen unter Einsatz magnetischer Separation ist das Ziel dieser Arbeit. Das Verfahren wird im fr{\"u}hen Stadium der Aufarbeitung genutzt, um CPC zu stabilisieren und somit die Produktausbeute zu erh{\"o}hen. Als Adsorbersysteme f{\"u}r CPC wurden neben einem projektinternen magnetischen Material ND 10322, dessen Oberfl{\"a}chenladungen spezifisch f{\"u}r die Bindung des Zielmolek{\"u}ls synthetisiert wurden, verschiedene kommerzielle Partikelsysteme verglichen. Es konnten massenspezifische Maximalbeladungen von 51 mg g⁻¹ erreicht werden. Weiterhin wurde die Stabilit{\"a}t von CPC untersucht. Unter optimalen Adsorptionsbedingungen kann CPC stabilisiert werden, so dass die Geschwindigkeitskonstante der Degradation des b-Lactam-Rings unter diesen Bedingungen unter 0,005 h⁻¹ liegt. Untersuchungen zur Wiederverwertbarkeit der neuen Adsorbers zeigten eine irreversible Bindung geringer CPC-Mengen nach dem ersten Einsatz. Nach zw{\"o}lf Zyklen tritt eine irreversible Bindung von CPC ein, was zu einer signifikanten Reduktion der Adsorptionsf{\"a}higkeit f{\"u}hrt. Die Anh{\"a}ufung des CPC auf dem Adsorber konnte durch IR-Untersuchungen auf die Bildung einer Peptidbindung zwischen Carboxylgruppen des CPC und Aminogruppe der Adsorberoberfl{\"a}che zur{\"u}ckgef{\"u}hrt werden.},
  language  = {de}
}
@misc{DuweTippkoetterLeipoldetal.2012,
  author    = {Duwe, A. and Tippk{\"o}tter, Nils and Leipold, D. and Riemer, S. and Zorn, H. and Ulber, Roland},
  title     = {Holzhydrolyse als Feststoffreaktion: Charakterisierung von Inhibitoren und Erh{\"o}hung der Ausbeute durch den Einsatz lignolytischer Enzyme},
  series = {Chemie Ingenieur Technik},
  volume    = {84},
  journal   = {Chemie Ingenieur Technik},
  number    = {8},
  publisher = {Wiley-VCH},
  address   = {Weinheim},
  issn      = {0009-286X},
  doi       = {10.1002/cite.201250298},
  pages     = {1307},
  year      = {2012},
  abstract  = {Der Erhalt m{\"o}glichst hoher Zuckerkonzentrationen f{\"u}r nachfolgende Fermentationen und eine Steigerung der Produktivit{\"a}t sind Ziele der Hydrolyse bei hohen Feststoffkonzentrationen im Rahmen des Projekts „Lignocellulose Bioraffinerie". Verwendet wird durch ein Organosolv-Verfahren aufgeschlossenes Buchenholz. Die Hydrolyse des Faserstoffes erfolgt mithilfe von CTec2-Enzymen (Fa. Novozymes). Zurzeit k{\"o}nnen unter Einsatz eines neuen Feststoffreaktors Cellulosefasern in einer Konzentration bis 400 g L⁻¹ enzymatisch hydrolysiert werden. Dabei werden Ausbeuten (g Glucose/g Cellulose im Faserstoff) bis 0,86 g g⁻¹ und Glucosekonzentrationenvon 120 g L⁻¹ erreicht. Ein Nachteil ist jedoch die hierbei auftretende Abnahme der Hydrolyseausbeuten. Zahlreiche Limitierungen bez{\"u}glich der Hydrolysierbarkeit von Lignocellulose werden zurzeit diskutiert und publiziert. Ziel der Untersuchungen ist die Identifizierung hydrolysehemmender Substanzen sowie die Erh{\"o}hung der Ausbeute an Zuckermonomeren durch den Einsatz lignolytischer Enzyme. Hierbei wird eine HPLC-MS-Methode zur Charakterisierung hemmender Substanzen eingesetzt, um potenzielle Inhibitoren zu erfassen.},
  language  = {de}
}
@article{SchiffelsPinkenburgScheldenetal.2013,
  author    = {Schiffels, Johannes and Pinkenburg, Olaf and Schelden, Maximilian and Aboulnaga, El-Hussiny A. A. and Baumann, Marcus and Selmer, Thorsten},
  title     = {An innovative cloning platform enables large-scale production and maturation of an oxygen-tolerant [NiFe]-hydrogenase from cupriavidus necator in Escherichia coli},
  series = {PLOS one. 2013},
  journal   = {PLOS one. 2013},
  publisher = {Public Library of Science},
  address   = {San Francisco, California},
  issn      = {1932-6203},
  doi       = {10.1371/journal.pone.0068812},
  year      = {2013},
  language  = {en}
}
@article{AboulnagaPinkenburgSchiffelsetal.2013,
  author    = {Aboulnaga, E. H. and Pinkenburg, O. and Schiffels, Johannes and El-Refai, A. and Buckel, W. and Selmer, Thorsten},
  title     = {Butyrate production in Escherichia coli: Exploitation of an oxygen tolerant bifurcating butyryl-CoA dehydrogenase/electron transferring flavoprotein complex from Clostridium difficile},
  series = {Journal of bacteriology. June 14, 2013},
  journal   = {Journal of bacteriology. June 14, 2013},
  issn      = {1098-5530 (E-Journal) ; 0021-9193 (Print)},
  pages     = {Epub ahead of print},
  year      = {2013},
  language  = {de}
}
@inproceedings{TakenagaHerreraWerneretal.2013,
  author    = {Takenaga, Shoko and Herrera, Cony F. and Werner, Frederik and Biselli, Manfred and Schnitzler, Thomas and Sch{\"o}ning, Michael Josef and {\"O}hlschl{\"a}ger, Peter and Wagner, Torsten},
  title     = {Detection of the metabolic activity of cells by differential measurements based on a single light-addressable potentiometric sensor chip},
  series = {11. Dresdner Sensor-Symposium : 9.-11.12.2013},
  booktitle = {11. Dresdner Sensor-Symposium : 9.-11.12.2013},
  organization    = {Dresdner Sensor-Symposium <11, 2013>},
  isbn      = {978-3-9813484-5-3},
  pages     = {63 -- 67},
  year      = {2013},
  language  = {en}
}
@article{DuttaHartkopfFroederWitteetal.2013,
  author    = {Dutta, Suryendu and Hartkopf-Fr{\"o}der, Christoph and Witte, Karin and Brocke, Rainer and Mann, Ulrich},
  title     = {Molecular characterization of fossil palynomorphs by transmission micro-FTIR spectroscopy: implications for hydrocarbon source evaluation},
  series = {International journal of coal geology},
  volume    = {Vol. 115},
  journal   = {International journal of coal geology},
  publisher = {Elsevier},
  address   = {Amsterdam},
  issn      = {1872-7840 (E-Journal); 0166-5162 (Print)},
  pages     = {13 -- 23},
  year      = {2013},
  language  = {en}
}
@article{MartinezJakobTuetal.2013,
  author    = {Martinez, Ronny and Jakob, Felix and Tu, Ran and Siegert, Petra and Maurer, Karl-Heinz and Schwaneberg, Ulrich},
  title     = {Increasing activity and thermal resistance of Bacillus gibsonii alkaline protease (BgAP) by directed evolution},
  series = {Biotechnology and bioengineering},
  volume    = {Vol. 110},
  journal   = {Biotechnology and bioengineering},
  number    = {Iss. 3},
  publisher = {Wiley},
  address   = {Weinheim},
  issn      = {1097-0290 (E-Journal); 0006-3592 (Print); 0368-1467 (Print)},
  pages     = {711 -- 720},
  year      = {2013},
  language  = {en}
}