TY - JOUR A1 - Grinsven, B. van A1 - Bon, N. vanden A1 - Grieten, L. A1 - Murib, M. A1 - Janssen, S. D. A1 - Haenen, K. A1 - Schneider, E. A1 - Ingebrandt, E. A1 - Schöning, Michael Josef A1 - Vermeeren, V. A1 - Ameloot, M. A1 - Michiels, L. A1 - Thoelen, R. A1 - Ceuninck, W. de A1 - Wagner, P. T1 - Rapid assessment of the stability of DNA duplexes by impedimetric real-time monitoring of chemically induced denaturation JF - Lab on a Chip Y1 - 2011 SN - 1473-0197 VL - 11 IS - 9 SP - 1656 EP - 1663 PB - Royal Society of Chemistry (RSC) CY - Cambridge ER - TY - JOUR A1 - Grinsven, Bart van A1 - Bon, Natalie vanden A1 - Strauven, Hannelore A1 - Grieten, Lars A1 - Murib, Mohammed A1 - Jiménez Monroy, Kathia L. A1 - Janssens, Stoffel D. A1 - Haenen, Ken A1 - Schöning, Michael Josef A1 - Vermeeren, Veronique A1 - Ameloot, Marcel A1 - Michiels, Luc A1 - Thoelen, Ronald A1 - Ceuninck, Ward de A1 - Wagner, Patrick T1 - Heat-Transfer Resistance at Solid-Liquid Interfaces: A Tool for The Detection of Single Nucleotide Polymorphisms in DNA. JF - ACS Nano N2 - In this article, we report on the heat-transfer resistance at interfaces as a novel, denaturation-based method to detect single-nucleotide polymorphisms in DNA. We observed that a molecular brush of double-stranded DNA grafted onto synthetic diamond surfaces does not notably affect the heat-transfer resistance at the solid-to-liquid interface. In contrast to this, molecular brushes of single-stranded DNA cause, surprisingly, a substantially higher heat-transfer resistance and behave like a thermally insulating layer. This effect can be utilized to identify ds-DNA melting temperatures via the switching from low- to high heat-transfer resistance. The melting temperatures identified with this method for different DNA duplexes (29 base pairs without and with built-in mutations) correlate nicely with data calculated by modeling. The method is fast, label-free (without the need for fluorescent or radioactive markers), allows for repetitive measurements, and can also be extended toward array formats. Reference measurements by confocal fluorescence microscopy and impedance spectroscopy confirm that the switching of heat-transfer resistance upon denaturation is indeed related to the thermal on-chip denaturation of DNA. Y1 - 2012 U6 - http://dx.doi.org/10.1021/nn300147e SN - 1936-086X VL - 6 IS - 3 SP - 2712 EP - 2721 PB - ACS Publications CY - Washington, DC ER - TY - CHAP A1 - Groebel, Simone A1 - Werner, Frederik A1 - Jörres, Niklas A1 - Jansen, F. A1 - Kasper, Katharina A1 - Schiffels, Johannes A1 - Sprenger, B. A1 - Baumann, Marcus A1 - Schöning, Michael Josef A1 - Selmer, Thorsten T1 - Entwicklung einer Sensor-Überwachung für Biogasanlagen auf Basis von Prozessdaten einer Parallelanlage T2 - 10. Dresdner Sensor-Symposium : Dresden, 5. - 7. Dezember 2011 ; miniaturisierte analytische Verfahren, Hochtemperatur-Sensoren, Sensoren für Bioprozess- und Verfahrenstechnik, Sensoren für die Medizin, Chemische Verfahrenstechnik, Lebensmittelanalytik, innovative Sensorlösungen, Sensoren für die Wasserqualität, Selbstüberwachung / Gerald Gerlach ... (Hg.) N2 - Beim Ausbau nachhaltiger, regenerativer Energieversorgung hat die Umwandlung von organischer Biomasse in Biogas ein großes Potential. Der zugrundeliegende, komplexe biologische Prozess wird noch immer unzureichend verstanden und bedarf systematischer Untersuchungen der Prozessparameter, um einen hohen Ertrag bei guter Gasqualität zu ermöglichen. Die Fragestellungen zur Entschlüsselung des Prozesses sind sowohl verfahrenstechnischer als auch mikrobiologischer Natur. Aus mikrobiologischer Sicht ist die Kenntnis der tatsächlich beteiligten prozesstragenden Mikroorganismen von erheblicher Bedeutung, aus verfahrenstechnischer Sicht die Kenntnis der physikalischen und chemischen Faktoren, welche die mikrobiologischen Prozesse und kontrollieren. Im Zusammenspiel aller dieser Parameter wird die Biogasbildung befördert oder behindert, bis zum Abbruch des Prozesses. Eine mögliche Kontrollmethode ist die Messung der metabolischen Aktivität prozesstragender Organismen. Diese soll, beruhend auf fundierten Prozessdaten, gewonnen durch eine Parallelanlage, mit einem lichtadressierbaren potentiometrischen Sensor-System (LAPS) realisiert werden. Dieser Sensor ist in der Lage, pH-Wert-änderungen zu detektieren, die durch den Stoffwechsel der auf dem Chip immobilisierten Organismen hervorgerufen werden, um eine Online-Überwachung von Biogasanlagen zu ermöglichen. Y1 - 2011 SN - 978-3-942710-53-4 U6 - http://dx.doi.org/10.5162/10dss2011/4.3 N1 - Dresdner Beiträge zur Sensorik 43 ; Dresdner Sensor-Symposium ; 10 ; 2011 ; Dresden ; Forschungsgesellschaft für Messtechnik, Sensorik und Medizintechnik ; Zehntes Dresdner Sensor-Symposium ; Dresdner Sensor-Symposium ; (10 ; 2011.12.05-07 ; Dresden) SP - 81 EP - 84 PB - TUDpress CY - Dresden ER - TY - JOUR A1 - Grotendorst, Johannes T1 - On calculating the rate of linear convergence of non-linear transformed sequences JF - Proceeding SNC '11 Proceedings of the 2011 International Workshop on Symbolic-Numeric Computation Y1 - 2011 SN - 978-1-4503-0515-0 SP - 24 EP - 33 PB - ACM CY - New York, NY ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - Computational Nanoscience: Do it yourself! : winter school, 14 - 22 February 2006, Forschungszentrum Jülich, Germany ; lecture notes / Grotendorst, Johannes Y1 - 2006 SN - 3-00-017350-1 N1 - NIC series ; 31 ; Forschungszentrum / John-von-Neumann-Institut für Computing PB - NIC CY - Jülich ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - GALA - Grünenthal Applied Life Science Analysis : Bericht ; [Projektdokumentation] / John von Neumann-Institut für Computing (NIC); Zentralinstitut für Angewandte Mathematik. Achim Kless und Johannes Grotendorst (Hrsg.) Y1 - 2006 SN - 3-00-017349-8 N1 - NIC-Serie ; 30 ; John von Neumann-Institut für Computing PB - NIC CY - Jülich ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - High performance computing in chemistry : report of the joint research project: High Performance Computing in Chemistry - HPC-Chem ; funded by the Federal Ministry for Education and Research (BMBF) ; period: 1 March 2001 - 29 February 2004 / ed. by Johannes Grotendorst Y1 - 2004 SN - 3-00-013618-5 N1 - NIC-Serie ; 25 ; John von Neumann Institute for Computing PB - NIC CY - Jülich ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - ComputerMathematik mit Maple Y1 - 2003 SN - 3-89336-325-4 PB - Forschungszentrum Jülich CY - Jülich ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - ComputerMathematik mit Maple / 2. Aufl. Y1 - 2003 SN - 3-89336-354-8 N1 - Schriften des Forschungszentrums Jülich : Reihe Informationstechnik ; 5 PB - Forschungszentrum Jülich CY - Jülich ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - Quantum simulations of complex many body systems/<1> Y1 - 2002 SN - 3-00-009057-6 N1 - NIC series ; 10 ; John-von-Neumann-Institut für Computing PB - Forschungszentrum Jülich CY - Jülich ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - Quantum simulations of complex many-body systems: from theory to algorithms : winter school, 25 February - 1 March 2002, Rolduc Conference Centre, Kerkrade, the Netherlands ; poster presentations / ed. by Johannes Grotendorst Y1 - 2002 SN - 3-00-009058-4 N1 - NIC series ; 11 ; Winter school ; (2002.02.25-03.01 : ; Kerkrade) PB - NIC CY - Jülich ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - Quantum Simulations of Complex Many-Body Systems: From Theory to Algorithms, Audio-Visual Lecture Notes / Grotendorst, Johannes [Ed.] Y1 - 2002 SN - 3-00-010000-8 N1 - NIC series ; 14 PB - NIC CY - Jülich ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - Workshop on Molecular Dynamics on Parallel Computers John von Neumann Institute for Computing (NIC), Research Centre Jülich, Germany 8 - 10 February 1999 Y1 - 2000 SN - 981-02-4232-8 N1 - Workshop on Molecular Dynamics on Parallel Computers <1999, Jülich> ; John-von-Neumann-Institut für Computing PB - World Scientific CY - Singapore ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - Modern methods and algorithms of quantum chemistry : winter school, 21 - 25 February 2000, Forschungszentrum Jülich, Germany ; proceedings / organized by John-von-Neumann-Institute for Computing (NIC). Ed. by Johannes Grotendorst ... 2. ed. Y1 - 2000 SN - 3-00-005834-6 N1 - NIC series ; 3 ; Forschungszentrum ; John-von-Neumann-Institut für Computing PB - NIC CY - Jülich ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - Modern methods and algorithms of quantum chemistry : winter school, 21 - 25 February 2000, Forschungszentrum Jülich, Germany ; proceedings / organized by John-von-Neumann-Institute for Computing (NIC). Ed. by Johannes Grotendorst ... Y1 - 2000 SN - 3-00-005618-1 N1 - NIC series ; 1 ; Forschungszentrum ; John-von-Neumann-Institut für Computing PB - NIC CY - Jülich ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - Modern methods and algorithms of quantum chemistry : winter school, 21 - 25 February 2000, Forschungszentrum Jülich, Germany ; Poster Presentations / organized by John-von-Neumann-Institute for Computing (NIC). Ed. by Johannes Grotendorst ... Y1 - 2000 SN - 3-00-005746-3 N1 - NIC series ; 2 ; Forschungszentrum ; John-von-Neumann-Institut für Computing PB - NIC CY - Jülich ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - Gekoppelte SMP-Systeme im wissenschaftlich-technischen Hochleistungsrechnen - Status und Entwicklungsbedarf : Analyse im Auftrag des BMBF / Federführung: Zentralinstitut für Angewandte Mathematik, Forschungszentrum Jülich GmbH ... Ansprechpartner: F. Hoßfeld Y1 - 1999 N1 - Förderkennzeichen BMBF 01 IR 903. - Engl. Zsfassung u.d.T.: Coupled SMP-systems for scientific high-performance computing. PB - Zentralinstitut für Angewandte Mathematik CY - Jülich ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - Multiscale Simulation Methods in Molecular Sciences : Institute for Advanced Simulation (IAS) ; winter school, 2 - 6 March 2009, Forschungszentrum Jülich, Germany ; lecture notes Y1 - 2009 SN - 978-3-9810843-8-2 CY - Jülich ER - TY - JOUR A1 - Grotendorst, Johannes T1 - Maple programs for converting series expansions to rational functions using the Levin transformation automatic generation of FORTRAN functions for numerical applications JF - Computer Physics Communications. 55 (1991), H. 3 Y1 - 1991 SN - 0010-4655 SP - 325 EP - 335 ER - TY - BOOK A1 - Grotendorst, Johannes T1 - Höchstleistungsrechnen in der Chemie / Esser, Rüdiger ; Grotendorst, Johannes ; Lewerenz, Marius [Eds.] Y1 - 1998 N1 - Tagung für industrielle Anwender vom 16. bis 18.2.1998 im Forschungszentrum Jülich ER -