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Amplifikation und Einsatz von ssDNA-Aptameren

  • Die wachsende Produktpalette von z. B. Pharmazeutika geht mit einer steigenden Nachfrage für hochsensitive/schonende Aufreinigungstechniken einher. Bisherige Verfahren führen oft zu geringer Reinheit und verminderter Bioaktivität, zeigen eine Limitation der Analytengröße oder bedingen dessen Modifikation. Durch die Kombination von mikroskaligen Magnetpartikeln und spezifisch wechselwirkenden Einzelstrang-DNA-Oligonukleotiden, den sog. ssDNA-Aptameren, sind eine höhere Selektivität/Reinheit und eine Automatisierung möglich. In diesem Kontext werden zum einen ssDNA-Amplifikationstechniken und zum anderen der praktische Einsatz von Aptameren in einer Magnetseparation vorgestellt. Die ssDNA-Synthese basiert auf einem In-vivo-dsDNA-Produktionsschritt mittels eines rekombinanten Escherichia coli. Die als High-copy-Plasmid organisierte Sequenz wird in vitro durch Kombination verschiedener enzymatischer Reaktionen in die funktionelle ssDNA überführt. Diese Technik bedingt nur minimale Instrumentierung bzw. Prozessregelung. Die zweite Synthesetechnik wird in Form eines In-vitro-Amplifikationsverfahrens realisiert und beruht auf dem Prinzip einer PCR (Potenzial zu einer Automatisierung bzw. Miniaturisierung). Die gewonnenen Aptamere werden im Anschluss in einem auf Magnetpartikeln basierten Trennverfahren zur Isolationvon 6xHis-tag-Proteinen bezüglich ihrer Eigenschaften untersucht.

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Metadaten
Author:R. Stadtmüller, S. Wollny, Nils TippkötterORCiD, Roland UlberORCiD
DOI:https://doi.org/10.1002/cite.201250112
ISSN:0009-286X
ISSN:1522-2640 (eISSN)
Parent Title (German):Chemie Ingenieur Technik
Publisher:Wiley-VCH
Place of publication:Weinheim
Document Type:Conference: Meeting Abstract
Language:German
Year of Completion:2012
Date of the Publication (Server):2024/07/01
Volume:84
Issue:8
First Page:1294
Note:
ProcessNet-Jahrestagung 2012 und 30. DECHEMA-Jahrestagung der Biotechnologen, 10. – 13. September 2012, Karlsruhe
Link:https://doi.org/10.1002/cite.201250112
Institutes:FH Aachen / Fachbereich Chemie und Biotechnologie
collections:Verlag / Wiley-VCH